左宗棠在垂死之际，记忆犹新台湾建省，但照旧未能比及天子亲允建立台湾省的好动静就殉职于福州任上。朝廷得此动静，纷繁吊唁左宗棠，并在京都设立专祠敬拜，醇亲王代天子致祭。 西太后一面应允建立水兵衙门，一面提出建筑园林供她养老。醇亲王无银子，只好乞助李鸿章。建立完善的水兵必要消费大批银两，而建筑园林更是花钱如流水，李鸿章为此也一筹莫展，此时孙毓汶提议设立“海防捐”，借此敛财，以解办水兵和修园林之难。 光绪十一年九月初五，清廷毕竟下旨台湾改成行省，命刘铭传为首任巡抚。于第二日，设立总理水兵事务衙门，醇亲王为总办大臣，李鸿章为会办大臣。1885年10月12日，台湾府毕竟改成台湾省。 李鸿章让刘铭传出任水兵会办，刘屡次婉拒。李鸿章筹算上折请奏，孙毓汶则挺身而出，以为有才能让刘铭传回心回心。